MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Syntrophus aciditrophicus SB chromosome

Total Repeats: 63464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007759	GAG	2	6	21	26	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007759	GAA	2	6	60	65	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007759	GCA	2	6	77	82	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007759	TCAA	2	8	100	107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_007759	T	6	6	119	124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007759	TTA	2	6	131	136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007759	TTG	2	6	141	146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007759	GAA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
9	NC_007759	A	6	6	213	218	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
10	NC_007759	TC	4	8	264	271	0 %	50 %	0 %	50 %	85857846
11	NC_007759	T	6	6	308	313	0 %	100 %	0 %	0 %	85857846
12	NC_007759	GATT	2	8	388	395	25 %	50 %	25 %	0 %	85857846
13	NC_007759	A	7	7	417	423	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
14	NC_007759	CGCTC	2	10	428	437	0 %	20 %	20 %	60 %	85857846
15	NC_007759	GAAA	2	8	447	454	75 %	0 %	25 %	0 %	85857846
16	NC_007759	A	7	7	452	458	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
17	NC_007759	A	6	6	480	485	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
18	NC_007759	GTTGCC	2	12	578	589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
19	NC_007759	CTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
20	NC_007759	GAAC	2	8	736	743	50 %	0 %	25 %	25 %	85857846
21	NC_007759	TC	3	6	748	753	0 %	50 %	0 %	50 %	85857846
22	NC_007759	GATG	2	8	814	821	25 %	25 %	50 %	0 %	85857846
23	NC_007759	GAA	2	6	857	862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
24	NC_007759	TCG	2	6	906	911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857846
25	NC_007759	GCC	2	6	954	959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
26	NC_007759	GCC	2	6	1000	1005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
27	NC_007759	A	7	7	1035	1041	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
28	NC_007759	GCC	2	6	1145	1150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857846
29	NC_007759	GAA	2	6	1167	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
30	NC_007759	GATCTG	2	12	1178	1189	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	85857846
31	NC_007759	CAT	2	6	1210	1215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857846
32	NC_007759	CGA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857846
33	NC_007759	GAA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857846
34	NC_007759	A	6	6	1398	1403	100 %	0 %	0 %	0 %	85857846
35	NC_007759	CAA	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857846
36	NC_007759	CTC	2	6	1511	1516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857846
37	NC_007759	CAA	2	6	1534	1539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007759	TTA	2	6	1621	1626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007759	TAAA	3	12	1639	1650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007759	A	6	6	1659	1664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007759	A	6	6	1742	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	85857847
42	NC_007759	GAAA	2	8	1762	1769	75 %	0 %	25 %	0 %	85857847
43	NC_007759	CTG	2	6	1795	1800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857847
44	NC_007759	ATC	2	6	1879	1884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857847
45	NC_007759	AGC	2	6	1885	1890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
46	NC_007759	CATT	2	8	1953	1960	25 %	50 %	0 %	25 %	85857847
47	NC_007759	GAT	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
48	NC_007759	TGA	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
49	NC_007759	ATG	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
50	NC_007759	ATG	2	6	2138	2143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
51	NC_007759	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	85857847
52	NC_007759	ATT	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857847
53	NC_007759	TGTT	2	8	2381	2388	0 %	75 %	25 %	0 %	85857847
54	NC_007759	TGA	2	6	2427	2432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857847
55	NC_007759	CAGC	2	8	2463	2470	25 %	0 %	25 %	50 %	85857847
56	NC_007759	TCT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857847
57	NC_007759	CGG	2	6	2518	2523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857847
58	NC_007759	GCG	2	6	2552	2557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857847
59	NC_007759	AAT	2	6	2572	2577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857847
60	NC_007759	CGA	2	6	2597	2602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
61	NC_007759	ACG	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857847
62	NC_007759	GAG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857847
63	NC_007759	GAA	3	9	2713	2721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857847
64	NC_007759	A	7	7	2868	2874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007759	AG	4	8	2911	2918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007759	GACA	2	8	2929	2936	50 %	0 %	25 %	25 %	85857848
67	NC_007759	ATT	2	6	2937	2942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
68	NC_007759	AAGG	2	8	3020	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	85857848
69	NC_007759	CAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
70	NC_007759	GTG	2	6	3050	3055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857848
71	NC_007759	CAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	85857848
72	NC_007759	GCC	2	6	3188	3193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857848
73	NC_007759	TGA	2	6	3201	3206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
74	NC_007759	CGT	2	6	3283	3288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
75	NC_007759	CTC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
76	NC_007759	CGA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857848
77	NC_007759	AGG	2	6	3574	3579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
78	NC_007759	TAT	2	6	3580	3585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
79	NC_007759	CAA	2	6	3610	3615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857848
80	NC_007759	GA	3	6	3651	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	85857848
81	NC_007759	TCT	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857848
82	NC_007759	ACC	2	6	3740	3745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
83	NC_007759	AGG	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
84	NC_007759	CAA	2	6	3811	3816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	85857848
85	NC_007759	GAA	2	6	3826	3831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
86	NC_007759	G	6	6	3849	3854	0 %	0 %	100 %	0 %	85857848
87	NC_007759	TG	3	6	3878	3883	0 %	50 %	50 %	0 %	85857848
88	NC_007759	AGACCA	2	12	3921	3932	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	85857848
89	NC_007759	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
90	NC_007759	AGC	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857848
91	NC_007759	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
92	NC_007759	AAG	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
93	NC_007759	TGG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	85857848
94	NC_007759	GGC	2	6	4202	4207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
95	NC_007759	AGG	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857848
96	NC_007759	ATG	2	6	4365	4370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
97	NC_007759	ATT	2	6	4397	4402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857848
98	NC_007759	CCGATG	2	12	4407	4418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	85857848
99	NC_007759	CTG	2	6	4445	4450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
100	NC_007759	T	6	6	4453	4458	0 %	100 %	0 %	0 %	85857848
101	NC_007759	GCC	2	6	4510	4515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857848
102	NC_007759	GAAAA	2	10	4532	4541	80 %	0 %	20 %	0 %	85857848
103	NC_007759	GAA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
104	NC_007759	TCC	2	6	4584	4589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
105	NC_007759	GCT	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857848
106	NC_007759	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857848
107	NC_007759	GA	3	6	4748	4753	50 %	0 %	50 %	0 %	85857848
108	NC_007759	GAT	2	6	4778	4783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
109	NC_007759	GAAG	2	8	4795	4802	50 %	0 %	50 %	0 %	85857848
110	NC_007759	CGG	2	6	4873	4878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857848
111	NC_007759	TTC	2	6	4892	4897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857848
112	NC_007759	AAT	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857848
113	NC_007759	A	7	7	5104	5110	100 %	0 %	0 %	0 %	85857848
114	NC_007759	GAGAA	2	10	5186	5195	60 %	0 %	40 %	0 %	85857848
115	NC_007759	CCT	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857848
116	NC_007759	GAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	85857848
117	NC_007759	CAC	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857848
118	NC_007759	GAAG	2	8	5329	5336	50 %	0 %	50 %	0 %	85857848
119	NC_007759	AGA	2	6	5388	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
120	NC_007759	TGAAA	2	10	5394	5403	60 %	20 %	20 %	0 %	85857849
121	NC_007759	CTATG	2	10	5418	5427	20 %	40 %	20 %	20 %	85857849
122	NC_007759	TTA	2	6	5432	5437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857849
123	NC_007759	CCG	2	6	5484	5489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	85857849
124	NC_007759	CCGC	2	8	5546	5553	0 %	0 %	25 %	75 %	85857849
125	NC_007759	TCG	2	6	5555	5560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
126	NC_007759	GAC	2	6	5686	5691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
127	NC_007759	TCC	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	85857849
128	NC_007759	GGC	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	85857849
129	NC_007759	GGA	2	6	5742	5747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	85857849
130	NC_007759	ACG	2	6	5795	5800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
131	NC_007759	TTC	2	6	5822	5827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	85857849
132	NC_007759	CTG	2	6	5848	5853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	85857849
133	NC_007759	ACGGC	2	10	5855	5864	20 %	0 %	40 %	40 %	85857849
134	NC_007759	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857849
135	NC_007759	ACC	2	6	5895	5900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	85857849
136	NC_007759	GAA	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	85857849
137	NC_007759	CCGGA	2	10	5987	5996	20 %	0 %	40 %	40 %	85857849
138	NC_007759	TTA	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	85857849
139	NC_007759	GGACG	2	10	6050	6059	20 %	0 %	60 %	20 %	85857849
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267	NC_007759	CT	3	6	11475	11480	0 %	50 %	0 %	50 %	85857853
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269	NC_007759	AATCG	2	10	11571	11580	40 %	20 %	20 %	20 %	85857853
270	NC_007759	ACG	2	6	11606	11611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	85857853
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272	NC_007759	TAA	2	6	11771	11776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	85857854
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